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深圳市今发展生物科技有限公司

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miRNA qRT-PCR检测

S-Poly(T)法检测miRNA原理:

S-Poly(T)®法融合了传统的Stem-loop法和Poly(A)加尾法的优点,使用了与miRNA 3`端特异互补的~6个碱基和11d(T)组成的S-Poly(T)®特异性逆转录引物,在较高温度下(≥42°C)对加尾后的miRNA进行第一链cDNA的合成,不仅显著提高S-Poly(T)逆转录引物与目的miRNA互补结合的特异性和热稳定性,而且逆转录效率更高,从而大幅提高目的miRNA一链cDNA的合成及后续qPCR效率。qPCR反应使用特异上游引物、通用下游引物和通用荧光探针对miRNA进行检测。示意图如下:

s-poly(T) plus示意图.jpg

1. S-Poly(T)法检测miRNA原理图

 

为什么要选择S-poly(T) plus技术进行miRNA表达谱分析?

ü  一步到位,检出率高

现有绘制miRNA表达谱的主要策略是miRNA芯片和高通量小RNA测序,其结果必须通过qPCR技术的验证;此外,由于灵敏度所限,芯片和测序技术常常出现漏检和误检等情况。用qPCR技术进行miRNA的表达谱分析将大幅提高差异miRNA的检出率和表达的准确性。

ü  引物分组,特异性高

基于S-poly(T)plus原理开发的miRNA qPCR表达谱分析技术是将S-poly(T)引物进行优化性分组,每组包括7miRNA1个内参的特异性反转录引物。优化性分组能最大限度提高cDNA合成的特异性,避免引物之间的相互干扰。数据显示,当同时使用20个以上的S-poly(T)引物进行反转录时,部分miRNA检测的灵敏度和特异性会受到一定影响。因此,我们开发的miRNA表达谱分析技术与现有市面上的同类产品相比,具有更高的灵敏性、特异性及性价比。

ü  高灵敏度,能检测特殊样品

由于灵敏度的显著提高,S-poly(T)plus技术特别适合从血清/血浆、尿液、粪便等材料中检测含量甚微的miRNA表达(图13)。Geneup公司也开发了这些材料的RNA提取试剂盒,建立了完整的体液/排泄物miRNA检测方案及服务平台。

图片1-13.png

13. S-Poly(T)plus方法检测血清miRNA。(A)比较S-Poly(T)S-Poly(T)plus检测血清miRNA的灵敏度;(B-F)将血清RNA进行4倍梯度稀释后,用S-Poly(T)plus法检测不同miRNA的表达水平。

应用实例:

1)组织和细胞miRNA检测

案例1 检测IgA肾病病人血清、尿液、肾组织石蜡切片中的二十多个miRNA表达

样品详细信息:

疾病名称

样本类型

IgA肾病

血清

尿液

石蜡组织

健康人对照

血清

尿液

石蜡组织

结果展示:

图片1.jpg

15. miRNAIgA肾病病人治疗前、治疗后及健康人血清中的表达

图片2.jpg

16. miRNAIgA肾病病人治疗前、治疗后及健康人尿液中的表达

图片3.jpg

17. miRNAIgA肾病及健康人石蜡组织中的表达

2)特定物种miRNA表达谱检测

案例2 小鼠成肌分化相关miRNA表达谱分析

图片6

18. 小鼠成肌细胞C2C12在分化培养基培养4天后检测720miRNAs的火山图


图片4.jpg

19. 表达量变化大于4倍的57miRNAs的表达变化热图(heat map

图片1.png

20. 192miRNAsC2C12细胞中的表达水平变化